Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC2P49815 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSC2P49815 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC2P49815 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC2P49815 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC2P49815 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC2P49815 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC2P49815 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC2P49815 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC2P49815 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC2P49815 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC2P49815 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC2P49815 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC2P49815 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC2P49815 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC2P49815 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC2P49815 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC2P49815 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSC2P49815 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSC2P49815 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSC2P49815 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSC2P49815 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSC2P49815 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC2P49815 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC2P49815 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC2P49815 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC2P49815 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC2P49815 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC2P49815 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC2P49815 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC2P49815 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC2P49815 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC2P49815 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC2P49815 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC2P49815 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC2P49815 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC2P49815 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC2P49815 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC2P49815 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC2P49815 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC2P49815 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSC2P49815 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC2P49815 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC2P49815 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC2P49815 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC2P49815 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC2P49815 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC2P49815 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC2P49815 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC2P49815 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC2P49815 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC2P49815 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC2P49815 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC2P49815 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC2P49815 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC2P49815 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC2P49815 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC2P49815 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TSC2P49815 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TSC2P49815 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSC2P49815 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC2P49815 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC2P49815 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC2P49815 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC2P49815 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC2P49815 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC2P49815 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC2P49815 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSC2P49815 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC2P49815 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC2P49815 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC2P49815 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC2P49815 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC2P49815 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC2P49815 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC2P49815 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC2P49815 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC2P49815 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC2P49815 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC2P49815 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms