Protein–RNA interactions for Protein: P49736

MCM2, DNA replication licensing factor MCM2, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM2P49736 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM2P49736 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM2P49736 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM2P49736 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM2P49736 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM2P49736 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM2P49736 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM2P49736 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM2P49736 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM2P49736 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM2P49736 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM2P49736 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM2P49736 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM2P49736 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM2P49736 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM2P49736 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM2P49736 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM2P49736 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM2P49736 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM2P49736 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM2P49736 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM2P49736 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM2P49736 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM2P49736 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM2P49736 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM2P49736 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM2P49736 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM2P49736 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM2P49736 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM2P49736 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM2P49736 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM2P49736 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM2P49736 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCM2P49736 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCM2P49736 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM2P49736 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM2P49736 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM2P49736 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM2P49736 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM2P49736 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM2P49736 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM2P49736 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM2P49736 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM2P49736 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM2P49736 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM2P49736 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM2P49736 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM2P49736 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM2P49736 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM2P49736 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM2P49736 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM2P49736 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM2P49736 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM2P49736 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM2P49736 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM2P49736 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM2P49736 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM2P49736 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM2P49736 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM2P49736 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM2P49736 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM2P49736 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM2P49736 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM2P49736 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM2P49736 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM2P49736 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM2P49736 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM2P49736 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM2P49736 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM2P49736 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM2P49736 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM2P49736 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM2P49736 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM2P49736 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM2P49736 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM2P49736 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM2P49736 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM2P49736 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM2P49736 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM2P49736 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM2P49736 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM2P49736 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM2P49736 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM2P49736 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM2P49736 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM2P49736 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM2P49736 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM2P49736 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM2P49736 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM2P49736 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM2P49736 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM2P49736 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms