Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NESP48681 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NESP48681 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
NESP48681 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
NESP48681 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
NESP48681 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
NESP48681 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC42.64■■■■■ 4.42
NESP48681 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
NESP48681 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
NESP48681 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
NESP48681 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
NESP48681 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
NESP48681 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
NESP48681 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
NESP48681 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
NESP48681 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
NESP48681 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
NESP48681 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
NESP48681 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
NESP48681 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
NESP48681 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
NESP48681 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
NESP48681 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NESP48681 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
NESP48681 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NESP48681 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NESP48681 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NESP48681 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NESP48681 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
NESP48681 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NESP48681 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NESP48681 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
NESP48681 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
NESP48681 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC42.57■■■■■ 4.4
NESP48681 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
NESP48681 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
NESP48681 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NESP48681 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
NESP48681 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
NESP48681 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
NESP48681 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
NESP48681 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
NESP48681 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
NESP48681 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NESP48681 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NESP48681 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
NESP48681 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NESP48681 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NESP48681 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
NESP48681 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NESP48681 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NESP48681 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NESP48681 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NESP48681 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
NESP48681 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
NESP48681 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NESP48681 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NESP48681 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NESP48681 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NESP48681 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NESP48681 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NESP48681 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NESP48681 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NESP48681 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NESP48681 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NESP48681 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NESP48681 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NESP48681 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
NESP48681 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
NESP48681 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
NESP48681 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
NESP48681 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NESP48681 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
NESP48681 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
NESP48681 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NESP48681 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
NESP48681 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
NESP48681 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NESP48681 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NESP48681 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NESP48681 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
NESP48681 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NESP48681 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NESP48681 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NESP48681 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
NESP48681 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
NESP48681 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
NESP48681 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
NESP48681 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
NESP48681 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
NESP48681 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
NESP48681 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NESP48681 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
NESP48681 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
NESP48681 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
NESP48681 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NESP48681 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
NESP48681 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
NESP48681 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
NESP48681 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms