Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCN1P48444 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCN1P48444 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms