Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT3P45378 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNT3P45378 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.5 ms