Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX11P35716 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX11P35716 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX11P35716 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX11P35716 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX11P35716 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX11P35716 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX11P35716 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX11P35716 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX11P35716 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX11P35716 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX11P35716 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX11P35716 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX11P35716 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX11P35716 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX11P35716 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX11P35716 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX11P35716 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX11P35716 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX11P35716 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX11P35716 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX11P35716 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX11P35716 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX11P35716 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX11P35716 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX11P35716 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX11P35716 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX11P35716 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX11P35716 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX11P35716 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX11P35716 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX11P35716 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX11P35716 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX11P35716 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX11P35716 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX11P35716 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX11P35716 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX11P35716 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX11P35716 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX11P35716 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX11P35716 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX11P35716 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX11P35716 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX11P35716 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX11P35716 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX11P35716 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX11P35716 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX11P35716 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX11P35716 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX11P35716 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX11P35716 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX11P35716 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX11P35716 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX11P35716 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX11P35716 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX11P35716 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms