Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD11P31277 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD11P31277 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms