Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC12P31275 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms