Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXA10P31260 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXA10P31260 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA10P31260 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms