Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD1CP29017 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD1CP29017 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD1CP29017 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD1CP29017 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD1CP29017 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD1CP29017 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD1CP29017 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD1CP29017 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD1CP29017 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD1CP29017 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD1CP29017 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD1CP29017 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD1CP29017 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD1CP29017 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD1CP29017 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD1CP29017 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD1CP29017 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD1CP29017 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD1CP29017 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD1CP29017 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD1CP29017 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD1CP29017 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD1CP29017 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD1CP29017 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD1CP29017 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD1CP29017 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD1CP29017 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD1CP29017 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD1CP29017 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD1CP29017 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD1CP29017 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD1CP29017 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD1CP29017 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD1CP29017 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD1CP29017 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD1CP29017 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD1CP29017 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD1CP29017 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD1CP29017 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD1CP29017 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD1CP29017 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD1CP29017 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD1CP29017 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD1CP29017 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD1CP29017 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD1CP29017 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD1CP29017 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD1CP29017 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD1CP29017 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD1CP29017 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD1CP29017 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD1CP29017 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD1CP29017 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD1CP29017 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD1CP29017 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD1CP29017 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD1CP29017 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD1CP29017 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD1CP29017 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD1CP29017 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD1CP29017 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD1CP29017 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD1CP29017 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD1CP29017 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD1CP29017 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD1CP29017 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD1CP29017 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD1CP29017 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD1CP29017 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD1CP29017 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD1CP29017 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD1CP29017 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD1CP29017 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD1CP29017 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD1CP29017 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms