Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD34P28906 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD34P28906 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD34P28906 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD34P28906 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD34P28906 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD34P28906 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD34P28906 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD34P28906 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD34P28906 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD34P28906 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD34P28906 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD34P28906 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD34P28906 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD34P28906 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD34P28906 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD34P28906 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD34P28906 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD34P28906 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD34P28906 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD34P28906 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD34P28906 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD34P28906 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD34P28906 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD34P28906 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD34P28906 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD34P28906 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD34P28906 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD34P28906 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD34P28906 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD34P28906 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD34P28906 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD34P28906 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD34P28906 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms