Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms