Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRBP23467 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRBP23467 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRBP23467 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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