Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEA1P23193 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms