Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2EP19388 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2EP19388 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2EP19388 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms