Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB2P14652 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB2P14652 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms