Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP4P12644 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP4P12644 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP4P12644 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP4P12644 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP4P12644 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP4P12644 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP4P12644 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BMP4P12644 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BMP4P12644 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP4P12644 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP4P12644 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP4P12644 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP4P12644 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP4P12644 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP4P12644 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP4P12644 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP4P12644 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BMP4P12644 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BMP4P12644 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BMP4P12644 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BMP4P12644 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BMP4P12644 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BMP4P12644 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BMP4P12644 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BMP4P12644 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BMP4P12644 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BMP4P12644 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BMP4P12644 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BMP4P12644 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BMP4P12644 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP4P12644 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP4P12644 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP4P12644 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP4P12644 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP4P12644 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP4P12644 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP4P12644 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP4P12644 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP4P12644 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP4P12644 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP4P12644 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP4P12644 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP4P12644 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BMP4P12644 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP4P12644 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP4P12644 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP4P12644 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP4P12644 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP4P12644 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP4P12644 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP4P12644 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP4P12644 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP4P12644 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP4P12644 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP4P12644 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP4P12644 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP4P12644 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP4P12644 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP4P12644 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP4P12644 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP4P12644 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP4P12644 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP4P12644 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP4P12644 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP4P12644 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP4P12644 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP4P12644 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP4P12644 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP4P12644 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP4P12644 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMP4P12644 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP4P12644 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms