Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PABPC1P11940 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC1P11940 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1P11940 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms