Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ODC1P11926 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ODC1P11926 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ODC1P11926 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ODC1P11926 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ODC1P11926 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ODC1P11926 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ODC1P11926 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ODC1P11926 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ODC1P11926 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ODC1P11926 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ODC1P11926 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ODC1P11926 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ODC1P11926 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ODC1P11926 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ODC1P11926 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ODC1P11926 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ODC1P11926 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ODC1P11926 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODC1P11926 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODC1P11926 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODC1P11926 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODC1P11926 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ODC1P11926 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ODC1P11926 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODC1P11926 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ODC1P11926 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ODC1P11926 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ODC1P11926 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ODC1P11926 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ODC1P11926 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ODC1P11926 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODC1P11926 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODC1P11926 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODC1P11926 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODC1P11926 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODC1P11926 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODC1P11926 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ODC1P11926 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ODC1P11926 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ODC1P11926 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ODC1P11926 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ODC1P11926 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ODC1P11926 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ODC1P11926 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ODC1P11926 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ODC1P11926 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODC1P11926 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODC1P11926 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODC1P11926 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODC1P11926 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODC1P11926 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODC1P11926 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ODC1P11926 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ODC1P11926 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ODC1P11926 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ODC1P11926 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ODC1P11926 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODC1P11926 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODC1P11926 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODC1P11926 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ODC1P11926 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODC1P11926 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODC1P11926 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODC1P11926 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODC1P11926 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODC1P11926 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODC1P11926 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ODC1P11926 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODC1P11926 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODC1P11926 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ODC1P11926 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODC1P11926 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ODC1P11926 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODC1P11926 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ODC1P11926 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms