Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB1P11230 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNB1P11230 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB1P11230 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms