Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI2P10070 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI2P10070 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GLI2P10070 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GLI2P10070 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GLI2P10070 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
GLI2P10070 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GLI2P10070 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GLI2P10070 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
GLI2P10070 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
GLI2P10070 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GLI2P10070 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GLI2P10070 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GLI2P10070 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GLI2P10070 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GLI2P10070 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GLI2P10070 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
GLI2P10070 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
GLI2P10070 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
GLI2P10070 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
GLI2P10070 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GLI2P10070 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GLI2P10070 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GLI2P10070 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GLI2P10070 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GLI2P10070 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GLI2P10070 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GLI2P10070 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GLI2P10070 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GLI2P10070 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GLI2P10070 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GLI2P10070 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
GLI2P10070 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GLI2P10070 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GLI2P10070 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GLI2P10070 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GLI2P10070 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
GLI2P10070 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GLI2P10070 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GLI2P10070 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GLI2P10070 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GLI2P10070 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GLI2P10070 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GLI2P10070 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GLI2P10070 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GLI2P10070 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GLI2P10070 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GLI2P10070 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GLI2P10070 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GLI2P10070 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GLI2P10070 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GLI2P10070 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GLI2P10070 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GLI2P10070 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
GLI2P10070 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GLI2P10070 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GLI2P10070 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GLI2P10070 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
GLI2P10070 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GLI2P10070 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GLI2P10070 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GLI2P10070 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GLI2P10070 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GLI2P10070 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GLI2P10070 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GLI2P10070 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI2P10070 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI2P10070 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI2P10070 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI2P10070 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI2P10070 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI2P10070 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI2P10070 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GLI2P10070 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GLI2P10070 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GLI2P10070 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GLI2P10070 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GLI2P10070 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GLI2P10070 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GLI2P10070 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GLI2P10070 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GLI2P10070 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI2P10070 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI2P10070 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI2P10070 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI2P10070 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI2P10070 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI2P10070 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI2P10070 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GLI2P10070 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GLI2P10070 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GLI2P10070 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
GLI2P10070 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GLI2P10070 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GLI2P10070 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GLI2P10070 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GLI2P10070 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GLI2P10070 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
GLI2P10070 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GLI2P10070 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms