Protein–RNA interactions for Protein: P0DH78

RNF224, RING finger protein 224, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF224P0DH78 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF224P0DH78 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF224P0DH78 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF224P0DH78 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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