Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00271P0C7V0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00271P0C7V0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms