Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI1P08151 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI1P08151 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI1P08151 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI1P08151 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI1P08151 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI1P08151 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI1P08151 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI1P08151 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI1P08151 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI1P08151 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI1P08151 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI1P08151 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI1P08151 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI1P08151 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI1P08151 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI1P08151 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI1P08151 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI1P08151 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI1P08151 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI1P08151 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI1P08151 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI1P08151 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI1P08151 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI1P08151 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI1P08151 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI1P08151 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI1P08151 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI1P08151 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GLI1P08151 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GLI1P08151 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI1P08151 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI1P08151 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI1P08151 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI1P08151 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI1P08151 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI1P08151 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI1P08151 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI1P08151 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI1P08151 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI1P08151 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI1P08151 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI1P08151 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI1P08151 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI1P08151 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI1P08151 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI1P08151 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI1P08151 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI1P08151 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI1P08151 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI1P08151 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI1P08151 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI1P08151 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI1P08151 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLI1P08151 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI1P08151 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI1P08151 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI1P08151 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI1P08151 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI1P08151 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLI1P08151 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GLI1P08151 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI1P08151 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI1P08151 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI1P08151 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI1P08151 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI1P08151 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GLI1P08151 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI1P08151 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI1P08151 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI1P08151 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI1P08151 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI1P08151 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI1P08151 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI1P08151 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GLI1P08151 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI1P08151 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI1P08151 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI1P08151 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GLI1P08151 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI1P08151 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI1P08151 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI1P08151 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI1P08151 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI1P08151 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI1P08151 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms