Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRB1P04280 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRB1P04280 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRB1P04280 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRB1P04280 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRB1P04280 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB1P04280 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB1P04280 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB1P04280 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB1P04280 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB1P04280 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB1P04280 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB1P04280 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRB1P04280 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRB1P04280 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRB1P04280 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRB1P04280 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRB1P04280 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRB1P04280 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB1P04280 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB1P04280 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB1P04280 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB1P04280 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB1P04280 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB1P04280 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB1P04280 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB1P04280 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRB1P04280 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRB1P04280 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRB1P04280 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRB1P04280 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRB1P04280 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRB1P04280 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRB1P04280 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRB1P04280 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB1P04280 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB1P04280 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB1P04280 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB1P04280 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB1P04280 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB1P04280 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB1P04280 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB1P04280 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRB1P04280 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRB1P04280 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRB1P04280 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRB1P04280 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRB1P04280 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRB1P04280 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRB1P04280 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRB1P04280 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRB1P04280 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRB1P04280 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRB1P04280 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRB1P04280 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRB1P04280 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRB1P04280 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRB1P04280 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PRB1P04280 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRB1P04280 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB1P04280 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRB1P04280 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRB1P04280 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRB1P04280 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRB1P04280 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRB1P04280 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRB1P04280 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB1P04280 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB1P04280 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB1P04280 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms