Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRNPP04156 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRNPP04156 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRNPP04156 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRNPP04156 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRNPP04156 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRNPP04156 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRNPP04156 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRNPP04156 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRNPP04156 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRNPP04156 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRNPP04156 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRNPP04156 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRNPP04156 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRNPP04156 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRNPP04156 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRNPP04156 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRNPP04156 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRNPP04156 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRNPP04156 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRNPP04156 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRNPP04156 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRNPP04156 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRNPP04156 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRNPP04156 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRNPP04156 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRNPP04156 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRNPP04156 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRNPP04156 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRNPP04156 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRNPP04156 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRNPP04156 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRNPP04156 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRNPP04156 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRNPP04156 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRNPP04156 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRNPP04156 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRNPP04156 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRNPP04156 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRNPP04156 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRNPP04156 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRNPP04156 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRNPP04156 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRNPP04156 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRNPP04156 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRNPP04156 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRNPP04156 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRNPP04156 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRNPP04156 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRNPP04156 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRNPP04156 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRNPP04156 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRNPP04156 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRNPP04156 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRNPP04156 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRNPP04156 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRNPP04156 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRNPP04156 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRNPP04156 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRNPP04156 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRNPP04156 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRNPP04156 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRNPP04156 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRNPP04156 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRNPP04156 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRNPP04156 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRNPP04156 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRNPP04156 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRNPP04156 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRNPP04156 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRNPP04156 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRNPP04156 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRNPP04156 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRNPP04156 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRNPP04156 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRNPP04156 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms