Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QAP02745 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QAP02745 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QAP02745 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QAP02745 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QAP02745 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QAP02745 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QAP02745 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QAP02745 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QAP02745 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QAP02745 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QAP02745 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QAP02745 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QAP02745 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QAP02745 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QAP02745 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QAP02745 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QAP02745 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QAP02745 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QAP02745 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QAP02745 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QAP02745 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QAP02745 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QAP02745 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QAP02745 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QAP02745 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QAP02745 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QAP02745 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QAP02745 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QAP02745 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QAP02745 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QAP02745 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QAP02745 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QAP02745 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QAP02745 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QAP02745 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QAP02745 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QAP02745 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QAP02745 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QAP02745 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QAP02745 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QAP02745 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QAP02745 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QAP02745 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QAP02745 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QAP02745 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QAP02745 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QAP02745 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QAP02745 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QAP02745 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QAP02745 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QAP02745 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QAP02745 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QAP02745 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QAP02745 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms