Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNB1P01574 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNB1P01574 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms