Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRUB2O95900 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRUB2O95900 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRUB2O95900 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms