Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf47O95873 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf47O95873 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms