Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNTO95613 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCNTO95613 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCNTO95613 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCNTO95613 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCNTO95613 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PCNTO95613 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCNTO95613 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCNTO95613 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCNTO95613 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PCNTO95613 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNTO95613 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNTO95613 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNTO95613 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNTO95613 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNTO95613 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNTO95613 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNTO95613 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNTO95613 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNTO95613 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNTO95613 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCNTO95613 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCNTO95613 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCNTO95613 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCNTO95613 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCNTO95613 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PCNTO95613 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PCNTO95613 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCNTO95613 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCNTO95613 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCNTO95613 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNTO95613 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNTO95613 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNTO95613 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNTO95613 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNTO95613 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNTO95613 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNTO95613 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNTO95613 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNTO95613 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNTO95613 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNTO95613 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNTO95613 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNTO95613 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNTO95613 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNTO95613 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNTO95613 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCNTO95613 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCNTO95613 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCNTO95613 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PCNTO95613 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PCNTO95613 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PCNTO95613 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNTO95613 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNTO95613 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNTO95613 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNTO95613 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNTO95613 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNTO95613 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNTO95613 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNTO95613 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNTO95613 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNTO95613 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNTO95613 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNTO95613 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNTO95613 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNTO95613 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNTO95613 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNTO95613 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNTO95613 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNTO95613 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNTO95613 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNTO95613 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNTO95613 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNTO95613 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNTO95613 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNTO95613 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNTO95613 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNTO95613 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNTO95613 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNTO95613 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNTO95613 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNTO95613 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNTO95613 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNTO95613 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCNTO95613 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCNTO95613 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCNTO95613 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCNTO95613 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCNTO95613 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCNTO95613 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms