Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN7O95471 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN7O95471 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms