Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC6AO75865 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC6AO75865 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms