Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COQ9O75208 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COQ9O75208 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ9O75208 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ9O75208 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ9O75208 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ9O75208 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ9O75208 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COQ9O75208 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COQ9O75208 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COQ9O75208 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ9O75208 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ9O75208 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ9O75208 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ9O75208 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COQ9O75208 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ9O75208 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ9O75208 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ9O75208 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ9O75208 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ9O75208 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COQ9O75208 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ9O75208 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ9O75208 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ9O75208 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ9O75208 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ9O75208 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ9O75208 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ9O75208 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COQ9O75208 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ9O75208 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ9O75208 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ9O75208 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ9O75208 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COQ9O75208 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COQ9O75208 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COQ9O75208 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COQ9O75208 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COQ9O75208 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ9O75208 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ9O75208 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ9O75208 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ9O75208 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ9O75208 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ9O75208 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ9O75208 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ9O75208 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ9O75208 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ9O75208 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ9O75208 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ9O75208 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ9O75208 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ9O75208 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ9O75208 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms