Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SYNJ1O43426 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SYNJ1O43426 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SYNJ1O43426 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
SYNJ1O43426 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SYNJ1O43426 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms