Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEPT4O43236 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SEPT4O43236 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEPT4O43236 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms