Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAPBPO15533 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAPBPO15533 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAPBPO15533 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms