Protein–RNA interactions for Protein: O15498

YKT6, Synaptobrevin homolog YKT6, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YKT6O15498 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
YKT6O15498 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YKT6O15498 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YKT6O15498 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YKT6O15498 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YKT6O15498 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YKT6O15498 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YKT6O15498 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YKT6O15498 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YKT6O15498 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YKT6O15498 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YKT6O15498 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YKT6O15498 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YKT6O15498 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YKT6O15498 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YKT6O15498 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YKT6O15498 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YKT6O15498 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YKT6O15498 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YKT6O15498 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YKT6O15498 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YKT6O15498 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YKT6O15498 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YKT6O15498 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YKT6O15498 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YKT6O15498 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YKT6O15498 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YKT6O15498 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YKT6O15498 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YKT6O15498 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YKT6O15498 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YKT6O15498 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YKT6O15498 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YKT6O15498 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YKT6O15498 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YKT6O15498 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YKT6O15498 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YKT6O15498 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YKT6O15498 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YKT6O15498 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YKT6O15498 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YKT6O15498 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YKT6O15498 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YKT6O15498 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YKT6O15498 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms