Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP290O15078 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP290O15078 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP290O15078 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP290O15078 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP290O15078 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP290O15078 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP290O15078 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP290O15078 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP290O15078 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP290O15078 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP290O15078 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP290O15078 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP290O15078 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP290O15078 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP290O15078 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP290O15078 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP290O15078 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP290O15078 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP290O15078 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP290O15078 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP290O15078 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP290O15078 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP290O15078 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP290O15078 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP290O15078 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP290O15078 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP290O15078 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP290O15078 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP290O15078 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP290O15078 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP290O15078 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP290O15078 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP290O15078 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP290O15078 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP290O15078 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP290O15078 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP290O15078 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP290O15078 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP290O15078 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP290O15078 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP290O15078 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP290O15078 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP290O15078 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP290O15078 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP290O15078 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP290O15078 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP290O15078 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP290O15078 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP290O15078 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP290O15078 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP290O15078 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP290O15078 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP290O15078 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP290O15078 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP290O15078 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP290O15078 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP290O15078 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP290O15078 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP290O15078 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP290O15078 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP290O15078 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP290O15078 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP290O15078 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP290O15078 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP290O15078 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP290O15078 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP290O15078 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP290O15078 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP290O15078 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP290O15078 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP290O15078 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP290O15078 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP290O15078 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP290O15078 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP290O15078 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP290O15078 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP290O15078 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP290O15078 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP290O15078 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP290O15078 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP290O15078 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP290O15078 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP290O15078 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP290O15078 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP290O15078 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
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