Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SETD1AO15047 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SETD1AO15047 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SETD1AO15047 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SETD1AO15047 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms