Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
APAF1O14727 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
APAF1O14727 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
APAF1O14727 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
APAF1O14727 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
APAF1O14727 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
APAF1O14727 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
APAF1O14727 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
APAF1O14727 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
APAF1O14727 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
APAF1O14727 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
APAF1O14727 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
APAF1O14727 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
APAF1O14727 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
APAF1O14727 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
APAF1O14727 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
APAF1O14727 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
APAF1O14727 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
APAF1O14727 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
APAF1O14727 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
APAF1O14727 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
APAF1O14727 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
APAF1O14727 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
APAF1O14727 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
APAF1O14727 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
APAF1O14727 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
APAF1O14727 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
APAF1O14727 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
APAF1O14727 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
APAF1O14727 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
APAF1O14727 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
APAF1O14727 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
APAF1O14727 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
APAF1O14727 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
APAF1O14727 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
APAF1O14727 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
APAF1O14727 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
APAF1O14727 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
APAF1O14727 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
APAF1O14727 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
APAF1O14727 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
APAF1O14727 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
APAF1O14727 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
APAF1O14727 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
APAF1O14727 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
APAF1O14727 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
APAF1O14727 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
APAF1O14727 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
APAF1O14727 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
APAF1O14727 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
APAF1O14727 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
APAF1O14727 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
APAF1O14727 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
APAF1O14727 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
APAF1O14727 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
APAF1O14727 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
APAF1O14727 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
APAF1O14727 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
APAF1O14727 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
APAF1O14727 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
APAF1O14727 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
APAF1O14727 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
APAF1O14727 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
APAF1O14727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
APAF1O14727 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
APAF1O14727 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
APAF1O14727 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
APAF1O14727 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
APAF1O14727 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
APAF1O14727 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
APAF1O14727 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
APAF1O14727 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
APAF1O14727 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
APAF1O14727 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
APAF1O14727 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
APAF1O14727 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
APAF1O14727 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
APAF1O14727 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
APAF1O14727 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
APAF1O14727 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
APAF1O14727 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
APAF1O14727 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
APAF1O14727 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
APAF1O14727 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
APAF1O14727 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
APAF1O14727 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
APAF1O14727 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
APAF1O14727 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
APAF1O14727 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
APAF1O14727 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
APAF1O14727 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms