Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QLW9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QLW9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QLW9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QLW9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
J3QLW9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QLW9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
J3QLW9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
J3QLW9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QLW9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QLW9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QLW9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QLW9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QLW9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QLW9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QLW9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QLW9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QLW9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QLW9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QLW9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QLW9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QLW9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QLW9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QLW9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QLW9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QLW9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QLW9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QLW9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QLW9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QLW9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QLW9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QLW9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QLW9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QLW9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QLW9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QLW9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QLW9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QLW9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QLW9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms