Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3KRW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3KRW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3KRW8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3KRW8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3KRW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3KRW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3KRW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3KRW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3KRW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3KRW8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3KRW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3KRW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3KRW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3KRW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3KRW8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KRW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KRW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KRW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KRW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KRW8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KRW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KRW8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KRW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3KRW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3KRW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3KRW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3KRW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3KRW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3KRW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3KRW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
J3KRW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3KRW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3KRW8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3KRW8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3KRW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3KRW8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3KRW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3KRW8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3KRW8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3KRW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3KRW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3KRW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3KRW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3KRW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3KRW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3KRW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3KRW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3KRW8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
J3KRW8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3KRW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3KRW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3KRW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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