Protein–RNA interactions for Protein: F8W735

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W735 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W735 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W735 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W735 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W735 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W735 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W735 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W735 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W735 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W735 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W735 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W735 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W735 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W735 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W735 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W735 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8W735 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8W735 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
F8W735 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8W735 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8W735 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
F8W735 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8W735 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8W735 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8W735 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8W735 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8W735 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8W735 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8W735 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8W735 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8W735 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8W735 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8W735 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8W735 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8W735 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8W735 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8W735 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8W735 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8W735 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
F8W735 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8W735 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8W735 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8W735 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8W735 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8W735 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8W735 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
F8W735 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
F8W735 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8W735 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8W735 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8W735 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8W735 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8W735 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8W735 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8W735 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8W735 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.8 ms