Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC160A6NGH7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC160A6NGH7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms