Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRG0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRG0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A1W2PRG0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A1W2PRG0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PRG0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms