Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.853e-8■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.133e-8■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-214ENST00000495305 1390 ntTSL 228■■■□□ 2.075e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.785e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-212ENST00000481705 636 ntTSL 525.93■■□□□ 1.745e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-216ENST00000498535 607 ntTSL 225.37■■□□□ 1.655e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.615e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-215ENST00000496169 1625 ntTSL 223.11■■□□□ 1.295e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-205ENST00000562823 514 ntTSL 421.28■■□□□ 15e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.915e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.913e-9■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.795e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-232ENST00000610893 578 ntTSL 419.84■□□□□ 0.775e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.695e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-239ENST00000622565 756 ntTSL 419.19■□□□□ 0.665e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-9■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-203ENST00000562286 556 ntTSL 418.85■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-211ENST00000569058 575 ntTSL 418.85■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.65e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-207ENST00000473444 720 ntTSL 318.44■□□□□ 0.545e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-231ENST00000602251 671 ntTSL 218.38■□□□□ 0.535e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-206ENST00000471104 1053 ntTSL 518.37■□□□□ 0.535e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.45e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ZFAND5-207ENST00000487330 631 ntTSL 217.33■□□□□ 0.365e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.355e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-213ENST00000569534 2262 ntTSL 217.17■□□□□ 0.345e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 217.13■□□□□ 0.335e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-212ENST00000569517 951 ntTSL 517.06■□□□□ 0.325e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.35e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-235ENST00000617753 580 ntTSL 416.84■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-206ENST00000563907 1041 ntTSL 316.68■□□□□ 0.265e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-212ENST00000595118 2446 ntTSL 216.23■□□□□ 0.195e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-207ENST00000593463 573 ntTSL 416.01■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-214ENST00000595665 576 ntTSL 416.01■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-218ENST00000597816 692 ntTSL 316.01■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-230ENST00000601464 477 ntTSL 516.01■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-236ENST00000618486 567 ntTSL 416.01■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-226ENST00000599724 910 ntTSL 515.75■□□□□ 0.115e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-229ENST00000601032 2019 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.15e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-233ENST00000612121 755 ntTSL 315.51■□□□□ 0.075e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-210ENST00000567941 2716 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-210ENST00000594448 573 ntTSL 514.88□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-234ENST00000612845 527 ntTSL 414.88□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-237ENST00000622107 590 ntTSL 414.83□□□□□ -0.045e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-204ENST00000467513 1133 ntTSL 514.46□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-228ENST00000600499 580 ntTSL 214.41□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.115e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 ADPGK-209ENST00000567733 525 ntTSL 514.28□□□□□ -0.125e-6■□□□□ 8.5
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ILF3Q12906 LTBP4-202ENST00000243562 3140 ntTSL 212.97□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-209ENST00000475010 3467 ntTSL 212.8□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 LTBP4-215ENST00000596351 512 ntTSL 212.05□□□□□ -0.485e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-210ENST00000475180 560 ntTSL 511.24□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 AC018638.2-201ENST00000471258 403 ntBASIC9.75□□□□□ -0.855e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-211ENST00000480552 906 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.895e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MKRN1-213ENST00000494939 784 ntTSL 38.25□□□□□ -1.095e-6■□□□□ 8.5
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ILF3Q12906 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.475e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.895e-6■□□□□ 8.5
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ILF3Q12906 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.541e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 RASSF1-204ENST00000395117 1745 ntTSL 218■□□□□ 0.471e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.532e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 GATAD2B-202ENST00000634401 867 ntTSL 516.48■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TKT-212ENST00000483706 565 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.012e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 GATAD2B-210ENST00000637331 145 ntTSL 513.79□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 513.65□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 SMYD3-203ENST00000391836 732 ntTSL 511.41□□□□□ -0.582e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 GATAD2B-207ENST00000634791 642 ntTSL 38.44□□□□□ -1.062e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.192e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.342e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 NFAT5-207ENST00000565301 653 ntTSL 25.09□□□□□ -1.592e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.642e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 NFAT5-205ENST00000562429 562 ntTSL 53.99□□□□□ -1.772e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 UBAC1-204ENST00000478485 773 ntTSL 223.82■■□□□ 1.43e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.642e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.422e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 BCR-212ENST00000479188 658 ntTSL 413.57□□□□□ -0.242e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 UBAC1-205ENST00000486258 243 ntTSL 39.4□□□□□ -0.93e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.091e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FLNA-217ENST00000498411 368 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 8.5
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