RNA: ENST00000495305.5

MKRN1-214, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKRN1, Length 1,390 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-214ENST00000495305 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.2■■■■■ 8.67
MKRN1-214ENST00000495305 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.67■■■■■ 7.46
MKRN1-214ENST00000495305 ABCC9O60706 1549 aa61.02■■■■■ 7.36
MKRN1-214ENST00000495305 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.37■■■■■ 6.93
MKRN1-214ENST00000495305 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.18■■■■■ 6.9
MKRN1-214ENST00000495305 NACADO15069 1562 aa58.18■■■■■ 6.9
MKRN1-214ENST00000495305 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.63■■■■■ 6.82
MKRN1-214ENST00000495305 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.53■■■■■ 6.8
MKRN1-214ENST00000495305 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.19■■■■■ 6.75
MKRN1-214ENST00000495305 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.99■■■■■ 6.71
MKRN1-214ENST00000495305 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.95■■■■■ 6.71
MKRN1-214ENST00000495305 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.64■■■■■ 6.66
MKRN1-214ENST00000495305 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.57■■■■■ 6.65
MKRN1-214ENST00000495305 SCRIBQ14160 1630 aa56.31■■■■■ 6.61
MKRN1-214ENST00000495305 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.96■■■■■ 6.55
MKRN1-214ENST00000495305 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.2■■■■■ 6.43
MKRN1-214ENST00000495305 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.11■■■■■ 6.41
MKRN1-214ENST00000495305 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.88■■■■■ 6.38
MKRN1-214ENST00000495305 SMARCA4P51532 1647 aa53.79■■■■■ 6.2
MKRN1-214ENST00000495305 NCAPD3P42695 1498 aa53.73■■■■■ 6.19
MKRN1-214ENST00000495305 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.69■■■■■ 6.18
MKRN1-214ENST00000495305 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.66■■■■■ 6.18
MKRN1-214ENST00000495305 SMARCA2P51531 1590 aa53.55■■■■■ 6.16
MKRN1-214ENST00000495305 HMGXB3Q12766 1538 aa53.37■■■■■ 6.13
MKRN1-214ENST00000495305 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.35■■■■■ 6.13
MKRN1-214ENST00000495305 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.26■■■■■ 6.12
MKRN1-214ENST00000495305 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.21■■■■■ 6.11
MKRN1-214ENST00000495305 WIZO95785 1651 aa52.7■■■■■ 6.03
MKRN1-214ENST00000495305 NESP48681 1621 aa52.64■■■■■ 6.02
MKRN1-214ENST00000495305 ERCC6Q03468 1493 aa52.63■■■■■ 6.02
MKRN1-214ENST00000495305 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.55■■■■■ 6
MKRN1-214ENST00000495305 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.35■■■■■ 5.97
MKRN1-214ENST00000495305 CUX2O14529 1486 aa52.24■■■■■ 5.95
MKRN1-214ENST00000495305 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.17■■■■■ 5.94
MKRN1-214ENST00000495305 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.11■■■■■ 5.93
MKRN1-214ENST00000495305 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.08■■■■■ 5.93
MKRN1-214ENST00000495305 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.9■■■■■ 5.9
MKRN1-214ENST00000495305 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.88■■■■■ 5.9
MKRN1-214ENST00000495305 CFTRP13569 1480 aa51.72■■■■■ 5.87
MKRN1-214ENST00000495305 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.56■■■■■ 5.84
MKRN1-214ENST00000495305 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.56■■■■■ 5.84
MKRN1-214ENST00000495305 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.56■■■■■ 5.84
MKRN1-214ENST00000495305 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.52■■■■■ 5.84
MKRN1-214ENST00000495305 WDR62O43379 1518 aa51.38■■■■■ 5.82
MKRN1-214ENST00000495305 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.36■■■■■ 5.81
MKRN1-214ENST00000495305 PRDM2Q13029 1718 aa51.12■■■■■ 5.77
MKRN1-214ENST00000495305 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.07■■■■■ 5.77
MKRN1-214ENST00000495305 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.89■■■■■ 5.74
MKRN1-214ENST00000495305 TOPBP1Q92547 1522 aa50.66■■■■■ 5.7
MKRN1-214ENST00000495305 ABCC8Q09428 1581 aa50.59■■■■■ 5.69
MKRN1-214ENST00000495305 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.51■■■■■ 5.68
MKRN1-214ENST00000495305 IFT140Q96RY7 1462 aa50.47■■■■■ 5.67
MKRN1-214ENST00000495305 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.32■■■■■ 5.65
MKRN1-214ENST00000495305 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.2■■■■■ 5.63
MKRN1-214ENST00000495305 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.11■■■■■ 5.61
MKRN1-214ENST00000495305 CUX1P39880 1505 aa50.07■■■■■ 5.61
MKRN1-214ENST00000495305 OSCARQ8IYS5 282 aa50.05■■■■■ 5.6
MKRN1-214ENST00000495305 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
MKRN1-214ENST00000495305 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.02■■■■■ 5.6
MKRN1-214ENST00000495305 SOGA1O94964 1423 aa50.01■■■■■ 5.6
MKRN1-214ENST00000495305 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50■■■■■ 5.59
MKRN1-214ENST00000495305 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.98■■■■■ 5.593e-7■■■□□ 17.1
MKRN1-214ENST00000495305 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.83■■■■■ 5.57
MKRN1-214ENST00000495305 WDR97A6NE52 1622 aa49.63■■■■■ 5.53
MKRN1-214ENST00000495305 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.56■■■■■ 5.52
MKRN1-214ENST00000495305 FBLN2P98095 1184 aa49.54■■■■■ 5.52
MKRN1-214ENST00000495305 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.48■■■■■ 5.51
MKRN1-214ENST00000495305 TRIM41Q8WV44 630 aa49.47■■■■■ 5.51
MKRN1-214ENST00000495305 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.47■■■■■ 5.51
MKRN1-214ENST00000495305 CHD1O14646 1710 aa49.46■■■■■ 5.51
MKRN1-214ENST00000495305 GRIN2BQ13224 1484 aa49.46■■■■■ 5.51
MKRN1-214ENST00000495305 TOP2BQ02880 1626 aa49.45■■■■■ 5.51
MKRN1-214ENST00000495305 SYNJ1O43426 1573 aa49.43■■■■■ 5.5
MKRN1-214ENST00000495305 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.42■■■■■ 5.5
MKRN1-214ENST00000495305 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.4■■■■■ 5.5
MKRN1-214ENST00000495305 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.37■■■■■ 5.49
MKRN1-214ENST00000495305 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.29■■■■■ 5.48
MKRN1-214ENST00000495305 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.28■■■■■ 5.48
MKRN1-214ENST00000495305 PBRM1Q86U86 1689 aa49.22■■■■■ 5.47
MKRN1-214ENST00000495305 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.22■■■■■ 5.47
MKRN1-214ENST00000495305 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.22■■■■■ 5.47
MKRN1-214ENST00000495305 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.22■■■■■ 5.47
MKRN1-214ENST00000495305 SYNJ2O15056 1496 aa49.21■■■■■ 5.47
MKRN1-214ENST00000495305 ARHGEF11O15085 1522 aa49.18■■■■■ 5.46
MKRN1-214ENST00000495305 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.97■■■■■ 5.43
MKRN1-214ENST00000495305 ADAMTS12P58397 1594 aa48.86■■■■■ 5.41
MKRN1-214ENST00000495305 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.85■■■■■ 5.41
MKRN1-214ENST00000495305 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.84■■■■■ 5.41
MKRN1-214ENST00000495305 GRIN2AQ12879 1464 aa48.81■■■■■ 5.4
MKRN1-214ENST00000495305 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.81■■■■■ 5.4
MKRN1-214ENST00000495305 ARAP1Q96P48 1450 aa48.77■■■■■ 5.4
MKRN1-214ENST00000495305 NUP160Q12769 1436 aa48.64■■■■■ 5.38
MKRN1-214ENST00000495305 CEP170Q5SW79 1584 aa48.59■■■■■ 5.37
MKRN1-214ENST00000495305 KIF27Q86VH2 1401 aa48.57■■■■■ 5.37
MKRN1-214ENST00000495305 IGF1RP08069 1367 aa48.48■■■■■ 5.35
MKRN1-214ENST00000495305 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.29■■■■■ 5.32
MKRN1-214ENST00000495305 SHROOM2Q13796 1616 aa48.27■■■■■ 5.32
MKRN1-214ENST00000495305 CUL7Q14999 1698 aa48.26■■■■■ 5.32
MKRN1-214ENST00000495305 JPH4Q96JJ6 628 aa48.19■■■■■ 5.31
MKRN1-214ENST00000495305 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.17■■■■■ 5.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms