RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496169.5

MKRN1-215, Transcript of makorin ring finger protein 1, human

TSL 2

Gene MKRN1, Length 1,625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKRN1-215	ENST00000496169	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.95	■■■■■ 6.71
MKRN1-215	ENST00000496169	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.74	■■■■■ 5.71
MKRN1-215	ENST00000496169	ABCC9	O60706	1549 aa		49.93	■■■■■ 5.58
MKRN1-215	ENST00000496169	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.89	■■■■■ 5.26
MKRN1-215	ENST00000496169	NACAD	O15069	1562 aa		47.76	■■■■■ 5.24
MKRN1-215	ENST00000496169	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.76	■■■■■ 5.24
MKRN1-215	ENST00000496169	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.37	■■■■■ 5.17
MKRN1-215	ENST00000496169	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.37	■■■■■ 5.17
MKRN1-215	ENST00000496169	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.08	■■■■■ 5.13
MKRN1-215	ENST00000496169	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.89	■■■■■ 5.1
MKRN1-215	ENST00000496169	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.64	■■■■■ 5.06
MKRN1-215	ENST00000496169	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.48	■■■■■ 5.03
MKRN1-215	ENST00000496169	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.3	■■■■■ 5
MKRN1-215	ENST00000496169	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.11	■■■■■ 4.97
MKRN1-215	ENST00000496169	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.88	■■■■■ 4.93
MKRN1-215	ENST00000496169	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.26	■■■■■ 4.84
MKRN1-215	ENST00000496169	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.16	■■■■■ 4.82
MKRN1-215	ENST00000496169	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.87	■■■■■ 4.77
MKRN1-215	ENST00000496169	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.26	■■■■■ 4.68
MKRN1-215	ENST00000496169	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.15	■■■■■ 4.66
MKRN1-215	ENST00000496169	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.08	■■■■■ 4.65
MKRN1-215	ENST00000496169	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.07	■■■■■ 4.65
MKRN1-215	ENST00000496169	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.99	■■■■■ 4.63
MKRN1-215	ENST00000496169	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.91	■■■■■ 4.62
MKRN1-215	ENST00000496169	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.82	■■■■■ 4.61
MKRN1-215	ENST00000496169	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.81	■■■■■ 4.6
MKRN1-215	ENST00000496169	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.69	■■■■■ 4.58
MKRN1-215	ENST00000496169	WIZ	O95785	1651 aa		43.45	■■■■■ 4.55
MKRN1-215	ENST00000496169	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
MKRN1-215	ENST00000496169	NES	P48681	1621 aa		43.14	■■■■■ 4.5
MKRN1-215	ENST00000496169	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.03	■■■■■ 4.48
MKRN1-215	ENST00000496169	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.96	■■■■■ 4.47
MKRN1-215	ENST00000496169	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
MKRN1-215	ENST00000496169	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.79	■■■■■ 4.44
MKRN1-215	ENST00000496169	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.68	■■■■■ 4.42
MKRN1-215	ENST00000496169	CUX2	O14529	1486 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MKRN1-215	ENST00000496169	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.64	■■■■■ 4.42
MKRN1-215	ENST00000496169	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
MKRN1-215	ENST00000496169	CFTR	P13569	1480 aa		42.48	■■■■■ 4.39
MKRN1-215	ENST00000496169	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.44	■■■■■ 4.39
MKRN1-215	ENST00000496169	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.3	■■■■■ 4.36
MKRN1-215	ENST00000496169	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.26	■■■■■ 4.36
MKRN1-215	ENST00000496169	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MKRN1-215	ENST00000496169	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.18	■■■■■ 4.34
MKRN1-215	ENST00000496169	WDR62	O43379	1518 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MKRN1-215	ENST00000496169	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
MKRN1-215	ENST00000496169	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.9	■■■■■ 4.3
MKRN1-215	ENST00000496169	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.7	■■■■■ 4.27
MKRN1-215	ENST00000496169	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.6	■■■■■ 4.25
MKRN1-215	ENST00000496169	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.57	■■■■■ 4.24
MKRN1-215	ENST00000496169	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.52	■■■■■ 4.24
MKRN1-215	ENST00000496169	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.38	■■■■■ 4.21
MKRN1-215	ENST00000496169	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.19
MKRN1-215	ENST00000496169	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.23	■■■■■ 4.19
MKRN1-215	ENST00000496169	CUX1	P39880	1505 aa		41.2	■■■■■ 4.19
MKRN1-215	ENST00000496169	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.18	■■■■■ 4.18
MKRN1-215	ENST00000496169	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.09	■■■■■ 4.17
MKRN1-215	ENST00000496169	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.07	■■■■■ 4.17
MKRN1-215	ENST00000496169	SOGA1	O94964	1423 aa		41.07	■■■■■ 4.16
MKRN1-215	ENST00000496169	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.06	■■■■■ 4.16
MKRN1-215	ENST00000496169	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41	■■■■■ 4.15	2e-7	■□□□□ 10.5
MKRN1-215	ENST00000496169	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.89	■■■■■ 4.14
MKRN1-215	ENST00000496169	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.13
MKRN1-215	ENST00000496169	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.82	■■■■■ 4.13
MKRN1-215	ENST00000496169	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.79	■■■■■ 4.12
MKRN1-215	ENST00000496169	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.77	■■■■■ 4.12
MKRN1-215	ENST00000496169	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.77	■■■■■ 4.12
MKRN1-215	ENST00000496169	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.76	■■■■■ 4.12
MKRN1-215	ENST00000496169	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.67	■■■■■ 4.1
MKRN1-215	ENST00000496169	CHD1	O14646	1710 aa		40.64	■■■■■ 4.1
MKRN1-215	ENST00000496169	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.6	■■■■■ 4.09
MKRN1-215	ENST00000496169	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.59	■■■■■ 4.09
MKRN1-215	ENST00000496169	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.58	■■■■■ 4.09
MKRN1-215	ENST00000496169	FBLN2	P98095	1184 aa		40.56	■■■■■ 4.08
MKRN1-215	ENST00000496169	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.54	■■■■■ 4.08
MKRN1-215	ENST00000496169	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.54	■■■■■ 4.08
MKRN1-215	ENST00000496169	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
MKRN1-215	ENST00000496169	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
MKRN1-215	ENST00000496169	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.36	■■■■■ 4.05
MKRN1-215	ENST00000496169	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MKRN1-215	ENST00000496169	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MKRN1-215	ENST00000496169	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MKRN1-215	ENST00000496169	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MKRN1-215	ENST00000496169	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MKRN1-215	ENST00000496169	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MKRN1-215	ENST00000496169	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MKRN1-215	ENST00000496169	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MKRN1-215	ENST00000496169	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.09	■■■■■ 4.01
MKRN1-215	ENST00000496169	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.08	■■■■■ 4.01
MKRN1-215	ENST00000496169	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.99	■■■■□ 3.99
MKRN1-215	ENST00000496169	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.91	■■■■□ 3.98
MKRN1-215	ENST00000496169	NUP160	Q12769	1436 aa		39.9	■■■■□ 3.98
MKRN1-215	ENST00000496169	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.89	■■■■□ 3.98
MKRN1-215	ENST00000496169	IGF1R	P08069	1367 aa		39.88	■■■■□ 3.98
MKRN1-215	ENST00000496169	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.87	■■■■□ 3.97
MKRN1-215	ENST00000496169	CUL7	Q14999	1698 aa		39.77	■■■■□ 3.96
MKRN1-215	ENST00000496169	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.65	■■■■□ 3.94
MKRN1-215	ENST00000496169	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.64	■■■■□ 3.94
MKRN1-215	ENST00000496169	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.61	■■■■□ 3.93
MKRN1-215	ENST00000496169	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.6	■■■■□ 3.93

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