RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498535.1

MKRN1-216, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKRN1, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-216ENST00000498535 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.34■■■■■ 7.73
MKRN1-216ENST00000498535 ABCC9O60706 1549 aa56.86■■■■■ 6.69
MKRN1-216ENST00000498535 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.82■■■■■ 6.69
MKRN1-216ENST00000498535 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.13■■■■■ 6.26
MKRN1-216ENST00000498535 NACADO15069 1562 aa53.75■■■■■ 6.2
MKRN1-216ENST00000498535 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.62■■■■■ 6.17
MKRN1-216ENST00000498535 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.3■■■■■ 6.12
MKRN1-216ENST00000498535 MYO15BQ96JP2 1530 aa53■■■■■ 6.07
MKRN1-216ENST00000498535 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.97■■■■■ 6.07
MKRN1-216ENST00000498535 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.81■■■■■ 6.04
MKRN1-216ENST00000498535 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.47■■■■■ 5.99
MKRN1-216ENST00000498535 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.47■■■■■ 5.99
MKRN1-216ENST00000498535 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.31■■■■■ 5.96
MKRN1-216ENST00000498535 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.85■■■■■ 5.89
MKRN1-216ENST00000498535 SCRIBQ14160 1630 aa51.79■■■■■ 5.88
MKRN1-216ENST00000498535 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.34■■■■■ 5.81
MKRN1-216ENST00000498535 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.23■■■■■ 5.79
MKRN1-216ENST00000498535 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.23■■■■■ 5.79
MKRN1-216ENST00000498535 NCAPD3P42695 1498 aa49.63■■■■■ 5.53
MKRN1-216ENST00000498535 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.46■■■■■ 5.51
MKRN1-216ENST00000498535 SMARCA4P51532 1647 aa49.4■■■■■ 5.5
MKRN1-216ENST00000498535 SMARCA2P51531 1590 aa49.36■■■■■ 5.49
MKRN1-216ENST00000498535 HMGXB3Q12766 1538 aa49.24■■■■■ 5.47
MKRN1-216ENST00000498535 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.19■■■■■ 5.46
MKRN1-216ENST00000498535 ERCC6Q03468 1493 aa49.15■■■■■ 5.46
MKRN1-216ENST00000498535 CUX2O14529 1486 aa49.02■■■■■ 5.44
MKRN1-216ENST00000498535 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
MKRN1-216ENST00000498535 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.01■■■■■ 5.44
MKRN1-216ENST00000498535 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.9■■■■■ 5.42
MKRN1-216ENST00000498535 NESP48681 1621 aa48.82■■■■■ 5.41
MKRN1-216ENST00000498535 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.79■■■■■ 5.4
MKRN1-216ENST00000498535 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.51■■■■■ 5.36
MKRN1-216ENST00000498535 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.29■■■■■ 5.32
MKRN1-216ENST00000498535 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.29■■■■■ 5.32
MKRN1-216ENST00000498535 WIZO95785 1651 aa48.2■■■■■ 5.31
MKRN1-216ENST00000498535 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.17■■■■■ 5.3
MKRN1-216ENST00000498535 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.14■■■■■ 5.3
MKRN1-216ENST00000498535 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.82■■■■■ 5.25
MKRN1-216ENST00000498535 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
MKRN1-216ENST00000498535 WDR62O43379 1518 aa47.66■■■■■ 5.22
MKRN1-216ENST00000498535 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.65■■■■■ 5.22
MKRN1-216ENST00000498535 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
MKRN1-216ENST00000498535 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.59■■■■■ 5.21
MKRN1-216ENST00000498535 CFTRP13569 1480 aa47.57■■■■■ 5.21
MKRN1-216ENST00000498535 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
MKRN1-216ENST00000498535 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.09■■■■■ 5.13
MKRN1-216ENST00000498535 PRDM2Q13029 1718 aa47.05■■■■■ 5.12
MKRN1-216ENST00000498535 TRIM41Q8WV44 630 aa46.91■■■■■ 5.1
MKRN1-216ENST00000498535 OSCARQ8IYS5 282 aa46.86■■■■■ 5.09
MKRN1-216ENST00000498535 IFT140Q96RY7 1462 aa46.7■■■■■ 5.07
MKRN1-216ENST00000498535 TOPBP1Q92547 1522 aa46.67■■■■■ 5.06
MKRN1-216ENST00000498535 ABCC8Q09428 1581 aa46.63■■■■■ 5.06
MKRN1-216ENST00000498535 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.58■■■■■ 5.05
MKRN1-216ENST00000498535 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.5■■■■■ 5.03
MKRN1-216ENST00000498535 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
MKRN1-216ENST00000498535 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
MKRN1-216ENST00000498535 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.19■■■■■ 4.99
MKRN1-216ENST00000498535 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.98
MKRN1-216ENST00000498535 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.14■■■■■ 4.98
MKRN1-216ENST00000498535 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.14■■■■■ 4.98
MKRN1-216ENST00000498535 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.14■■■■■ 4.98
MKRN1-216ENST00000498535 SOGA1O94964 1423 aa46.03■■■■■ 4.96
MKRN1-216ENST00000498535 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.02■■■■■ 4.96
MKRN1-216ENST00000498535 ARHGEF11O15085 1522 aa46.01■■■■■ 4.96
MKRN1-216ENST00000498535 FBLN2P98095 1184 aa45.99■■■■■ 4.95
MKRN1-216ENST00000498535 CHD1O14646 1710 aa45.96■■■■■ 4.95
MKRN1-216ENST00000498535 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
MKRN1-216ENST00000498535 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.91■■■■■ 4.94
MKRN1-216ENST00000498535 CUX1P39880 1505 aa45.84■■■■■ 4.93
MKRN1-216ENST00000498535 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
MKRN1-216ENST00000498535 WDR97A6NE52 1622 aa45.79■■■■■ 4.92
MKRN1-216ENST00000498535 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.75■■■■■ 4.91
MKRN1-216ENST00000498535 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.71■■■■■ 4.91
MKRN1-216ENST00000498535 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
MKRN1-216ENST00000498535 GRIN2BQ13224 1484 aa45.61■■■■■ 4.89
MKRN1-216ENST00000498535 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
MKRN1-216ENST00000498535 ARAP1Q96P48 1450 aa45.54■■■■■ 4.88
MKRN1-216ENST00000498535 SYNJ1O43426 1573 aa45.47■■■■■ 4.87
MKRN1-216ENST00000498535 SYNJ2O15056 1496 aa45.46■■■■■ 4.87
MKRN1-216ENST00000498535 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.46■■■■■ 4.87
MKRN1-216ENST00000498535 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.43■■■■■ 4.86
MKRN1-216ENST00000498535 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.39■■■■■ 4.86
MKRN1-216ENST00000498535 PBRM1Q86U86 1689 aa45.37■■■■■ 4.85
MKRN1-216ENST00000498535 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
MKRN1-216ENST00000498535 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.28■■■■■ 4.84
MKRN1-216ENST00000498535 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.26■■■■■ 4.84
MKRN1-216ENST00000498535 TOP2BQ02880 1626 aa45.12■■■■■ 4.81
MKRN1-216ENST00000498535 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.11■■■■■ 4.81
MKRN1-216ENST00000498535 GRIN2AQ12879 1464 aa45.01■■■■■ 4.8
MKRN1-216ENST00000498535 ADAMTS12P58397 1594 aa44.95■■■■■ 4.79
MKRN1-216ENST00000498535 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.89■■■■■ 4.78
MKRN1-216ENST00000498535 NUP160Q12769 1436 aa44.84■■■■■ 4.77
MKRN1-216ENST00000498535 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.83■■■■■ 4.77
MKRN1-216ENST00000498535 CEP170Q5SW79 1584 aa44.81■■■■■ 4.76
MKRN1-216ENST00000498535 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.71■■■■■ 4.75
MKRN1-216ENST00000498535 SHROOM2Q13796 1616 aa44.61■■■■■ 4.73
MKRN1-216ENST00000498535 JPH4Q96JJ6 628 aa44.46■■■■■ 4.71
MKRN1-216ENST00000498535 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
MKRN1-216ENST00000498535 KIF27Q86VH2 1401 aa44.32■■■■■ 4.68
MKRN1-216ENST00000498535 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.31■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms